Dyrektywy PHP i PleskNa szczególną uwagę zasługuje temat dyrektyw PHP (np. register_globals, safe_mode, display_errors). Problematyka ta nie została optymalnie rozwiązana w przypadku panelu Plesk. Pomimo małego ulepszenia – wersja 8.0 przyniosła obsługę dyrektywy safe_mode bezpośrednio w panelu – nadal konieczna jest ręczna ingerencja w celu włączania lub wyłączania tych funkcji. Zmiana tych dyrektyw przeprowadzane być powinny z reguły lokalnie, czyli tylko dla konkretnej domeny. Oczywiście istnieje również możliwość globalnych zmian ustawień serwera, konieczna jest wówczas edycja plików konfiguracyjnych, takich jak np.: php.ini, httpd.conf lub apache2.conf.
Zmianę tego ustawienia przeprowadzić może tylko użytkownik zalogowany w panelu jako admin, czyli Administrator. Dla użytkownika/administratora domeny opcja ta jest niedostępna.
php_flag register_globals off lub php_flag register_globals on Plik ten należy umieścić w katalogu, od którego ma obowiązywać (w normalnym wypadku /httpdocs), wpis ten zmienia ustawienia wszystkich podkatalogów leżących w tym katalogu.
w katalogu tym utworzyć należy plik o nazwie host.conf, z następującą zawartością: php_admin_flag register_globals on Uwaga! Aby zmiany te zostały przejęte przez Plesk, należy wykonać następującą komendę: /usr/local/psa/admin/sbin/websrvmng --reconfigure-vhost --vhost-name=<domena-użytkownika.pl> gdzie <domena-użytkownika.pl> zastąpić należy właściwą domeną. Przykład takiej komendy w przypadku domeny xxl-web.pl byłby: /usr/local/psa/admin/sbin/websrvmng --reconfigure-vhost --vhost-name= xxl-web.pl Po wykonaniu tej domeny konieczne jest jeszcze restartowanie Apache. Ponieważ w przypadku niektórych ustawień zwykła komenda reload lub restart nie jest wystarczająca, najpewniej jest zatrzymanie tej usługi, a następnie jej wystartowanie: Te same zasady obowiązują dla pozostałych dyrektyw, jak np. display_errors. Uwaga! Komenda powodująca przejęcie zmian ogólnych, obowiązujących globalnie, czyli nie tylko dla jednej domeny, jest następująca: /usr/local/psa/admin/sbin/websrvmng -a –v |